Einzeltreffer — DigiBib

Unlabelled: Mechanistic studies of many processes in Agrobacterium tumefaciens have been hampered by a lack of genetic tools for characterization of essential genes. In this study, we used a Tn7-based method for inducible control of transcription from an engineered site on the chromosome. We demonstrate that this method enables tighter control of inducible promoters than plasmid-based systems and can be used for depletion studies. The method enables the construction of depletion strains to characterize the roles of essential genes in A. tumefaciens Here, we used the strategy to deplete the alphaproteobacterial master regulator CtrA and found that depletion of this essential gene results in dramatic rounding of cells, which become nonviable.

Importance: Agrobacterium tumefaciens is a bacterial plant pathogen and natural genetic engineer. Thus, studies of essential processes, including cell cycle progression, DNA replication and segregation, cell growth, and division, may provide insights for limiting disease or improving biotechnology applications.

Titel:	Mini-Tn7 Insertion in an Artificial attTn7 Site Enables Depletion of the Essential Master Regulator CtrA in the Phytopathogen Agrobacterium tumefaciens.
Autor/in / Beteiligte Person:	Figueroa-Cuilan, W ; Daniel, JJ ; Howell, M ; Sulaiman, A ; Brown, PJ
Zeitschrift:	Applied and environmental microbiology, Jg. 82 (2016-07-29), Heft 16, S. 5015-25
Veröffentlichung:	Washington, American Society for Microbiology., 2016
Medientyp:	academicJournal
ISSN:	1098-5336 (electronic)
DOI:	10.1128/AEM.01392-16
Schlagwort:	DNA Transposable Elements Promoter Regions, Genetic Agrobacterium tumefaciens genetics Bacterial Proteins genetics Gene Expression Regulation, Bacterial Genes, Essential
Sonstiges:	Nachgewiesen in: MEDLINE Sprachen: English Publication Type: Journal Article Language: English [Appl Environ Microbiol] 2016 Jul 29; Vol. 82 (16), pp. 5015-25. <i>Date of Electronic Publication: </i>2016 Jul 29 (<i>Print Publication: </i>2016). MeSH Terms: Gene Expression Regulation, Bacterial* ; Genes, Essential* ; Agrobacterium tumefaciens / genetics ; Bacterial Proteins / genetics ; DNA Transposable Elements ; Promoter Regions, Genetic References: FEMS Microbiol Lett. 2009 Sep;298(1):111-7. (PMID: 19659730) ; Cell. 1996 Jan 12;84(1):83-93. (PMID: 8548829) ; BMC Syst Biol. 2010 Apr 28;4:52. (PMID: 20426835) ; Curr Opin Microbiol. 2009 Dec;12(6):708-14. (PMID: 19879182) ; Appl Environ Microbiol. 2013 Jan;79(2):718-21. (PMID: 23124231) ; Gene. 1983 Nov;25(2-3):167-78. (PMID: 6363212) ; Anal Chem. 2004 Nov 1;76(21):6282-6. (PMID: 15516119) ; Appl Environ Microbiol. 2008 Feb;74(4):1064-75. (PMID: 18156318) ; Arch Microbiol. 2011 Jun;193(6):451-9. (PMID: 21243338) ; Mol Microbiol. 2002 Feb;43(4):945-60. (PMID: 11929544) ; J Bacteriol. 2011 Sep;193(18):4984-7. (PMID: 21764912) ; Mol Microbiol. 2014 Aug;93(4):713-35. (PMID: 24975755) ; Res Microbiol. 2012 Nov-Dec;163(9-10):674-84. (PMID: 23103488) ; Proc Natl Acad Sci U S A. 2012 Jan 31;109(5):1697-701. (PMID: 22307633) ; Mol Microbiol. 2013 Sep;89(5):929-48. (PMID: 23829710) ; Cell Microbiol. 2007 Jan;9(1):9-20. (PMID: 17222189) ; Nucleic Acids Res. 2007;35(20):e137. (PMID: 17959646) ; PLoS One. 2013;8(2):e56682. (PMID: 23437210) ; Trends Plant Sci. 2003 Aug;8(8):380-6. (PMID: 12927971) ; J Bacteriol. 2006 Oct;188(19):6932-42. (PMID: 16980496) ; Traffic. 2011 May;12 (5):543-8. (PMID: 21255213) ; MBio. 2014 May 27;5(3):e01219-14. (PMID: 24865559) ; Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 2007 Jul 29;362(1483):1135-48. (PMID: 17360279) ; Microbiology. 2010 Jun;156(Pt 6):1673-85. (PMID: 20203055) ; Nat Rev Mol Cell Biol. 2001 Nov;2(11):806-14. (PMID: 11715047) ; Trends Genet. 2006 Jan;22(1):29-37. (PMID: 16289425) ; Nat Biotechnol. 2006 Jan;24(1):79-88. (PMID: 16369541) ; J Bacteriol. 2000 Feb;182(3):782-8. (PMID: 10633114) ; Trends Microbiol. 2015 Jun;23(6):347-53. (PMID: 25662291) ; J Bacteriol. 1975 Jul;123(1):255-64. (PMID: 1141196) ; Curr Protoc Microbiol. 2012 Feb;Chapter 1:Unit3D.1. (PMID: 22307549) ; Microbiol Mol Biol Rev. 2003 Mar;67(1):16-37, table of contents. (PMID: 12626681) ; PLoS Genet. 2015 May 15;11(5):e1005232. (PMID: 25978424) ; J Bacteriol. 2012 Jun;194(11):2973-86. (PMID: 22467786) ; Curr Protoc Microbiol. 2012 May;Chapter 3:Unit 3D.2. (PMID: 22549163) ; Proc Natl Acad Sci U S A. 2013 May 28;110(22):9060-5. (PMID: 23674672) ; Mol Gen Genet. 1979 Feb 26;170(2):161-9. (PMID: 107392) ; Microbiol Mol Biol Rev. 2009 Dec;73(4):775-808. (PMID: 19946141) ; Annu Rev Microbiol. 2007;61:401-22. (PMID: 17506679) ; Appl Environ Microbiol. 2008 Aug;74(16):5053-62. (PMID: 18606801) ; Front Plant Sci. 2014 May 06;5:176. (PMID: 24834068) ; Appl Environ Microbiol. 2012 Sep;78(17):6001-8. (PMID: 22706059) ; Proc Natl Acad Sci U S A. 1983 Jan;80(1):21-5. (PMID: 6337371) ; Int J Dev Biol. 2013;57(6-8):467-81. (PMID: 24166430) ; Curr Protoc Microbiol. 2012 May;Chapter 3:Unit 3D.3. (PMID: 22549164) ; Nat Methods. 2005 Jun;2(6):443-8. (PMID: 15908923) ; Front Plant Sci. 2015 Jan 06;5:730. (PMID: 25610442) ; Nat Protoc. 2006;1(1):153-61. (PMID: 17406227) ; J Microbiol Methods. 2010 Sep;82(3):296-300. (PMID: 20638421) Grant Information: R25 GM056901 United States GM NIGMS NIH HHS Substance Nomenclature: 0 (Bacterial Proteins) ; 0 (DNA Transposable Elements) Entry Date(s): Date Created: 20160612 Date Completed: 20171103 Latest Revision: 20201209 Update Code: 20240513 PubMed Central ID: PMC4968531

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