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LytB and GcpE, because they are codistributed with other pathway enzymes, have been predicted to catalyze unknown steps in the nonmevalonate pathway for isoprenoid biosynthesis. We constructed a conditional Escherichia coli lytB mutant and found that LytB is essential for survival and that depletion of LytB results in cell lysis, which is consistent with a role for this protein in isoprenoid biosynthesis. Alcohols which can be converted to pathway intermediates beyond the hypothesized LytB step(s) support limited growth of E. coli lytB mutants. An informatic analysis of protein structure suggested that GcpE is a globular protein of the TIM barrel class and that LytB is also a globular protein. Possible biochemical roles for LytB and GcpE are suggested.

Titel:	The lytB gene of Escherichia coli is essential and specifies a product needed for isoprenoid biosynthesis.
Autor/in / Beteiligte Person:	McAteer, S ; Coulson, A ; McLennan, N ; Masters, M
Zeitschrift:	Journal of bacteriology, Jg. 183 (2001-12-01), Heft 24, S. 7403-7
Veröffentlichung:	Washington, DC : American Society for Microbiology, 2001
Medientyp:	academicJournal
ISSN:	0021-9193 (print)
DOI:	10.1128/JB.183.24.7403-7407.2001
Schlagwort:	Amino Acid Sequence Bacterial Proteins chemistry Escherichia coli metabolism Genes, Essential Models, Biological Models, Chemical Molecular Sequence Data Pentosephosphates metabolism Protein Structure, Secondary Protein Structure, Tertiary Bacterial Proteins genetics Enzymes Escherichia coli genetics Escherichia coli Proteins Genes, Bacterial Oxidoreductases Terpenes metabolism
Sonstiges:	Nachgewiesen in: MEDLINE Sprachen: English Publication Type: Journal Article; Research Support, Non-U.S. Gov't Language: English [J Bacteriol] 2001 Dec; Vol. 183 (24), pp. 7403-7. MeSH Terms: Enzymes* ; Escherichia coli Proteins* ; Genes, Bacterial* ; Oxidoreductases* ; Bacterial Proteins / genetics ; Escherichia coli / genetics ; Terpenes / *metabolism ; Amino Acid Sequence ; Bacterial Proteins / chemistry ; Escherichia coli / metabolism ; Genes, Essential ; Models, Biological ; Models, Chemical ; Molecular Sequence Data ; Pentosephosphates / metabolism ; Protein Structure, Secondary ; Protein Structure, Tertiary References: J Biol Chem. 2000 Jun 30;275(26):19928-32. (PMID: 10787409) ; Annu Rev Plant Physiol Plant Mol Biol. 1999 Jun;50:47-65. (PMID: 15012203) ; J Bacteriol. 2001 Apr;183(8):2411-6. (PMID: 11274098) ; Science. 1997 Sep 5;277(5331):1453-62. (PMID: 9278503) ; J Biol Chem. 1987 May 25;262(15):7391-7. (PMID: 3294831) ; FEBS Lett. 2000 May 19;473(3):328-32. (PMID: 10818234) ; Proc Natl Acad Sci U S A. 1999 Oct 12;96(21):11758-63. (PMID: 10518523) ; Nat Biotechnol. 1998 Sep;16(9):851-6. (PMID: 9743119) ; Proc Natl Acad Sci U S A. 2000 Feb 1;97(3):1062-7. (PMID: 10655484) ; Microbiol Mol Biol Rev. 1998 Sep;62(3):985-1019. (PMID: 9729612) ; Proc Natl Acad Sci U S A. 2000 May 23;97(11):5978-83. (PMID: 10811905) ; Proc Natl Acad Sci U S A. 2000 Mar 14;97(6):2486-90. (PMID: 10694574) ; J Bacteriol. 1999 Aug;181(15):4499-504. (PMID: 10419945) ; FEBS Lett. 2001 Jan 19;488(3):170-3. (PMID: 11163766) ; J Biol Chem. 1997 Jun 20;272(25):15697-701. (PMID: 9188461) ; J Bacteriol. 1997 Oct;179(20):6228-37. (PMID: 9335267) ; Gene. 1984 Nov;31(1-3):165-71. (PMID: 6098521) ; Methods Enzymol. 1996;266:525-39. (PMID: 8743704) ; J Bacteriol. 1995 Jul;177(14):4121-30. (PMID: 7608087) ; J Bacteriol. 1989 Jul;171(7):3619-28. (PMID: 2661529) ; J Bacteriol. 2000 Oct;182(20):5841-8. (PMID: 11004185) ; Can J Biochem. 1982 Mar;60(3):338-46. (PMID: 6282422) ; J Bacteriol. 1998 Sep;180(17):4621-7. (PMID: 9721304) Substance Nomenclature: 0 (1-deoxylulose 5-phosphate) ; 0 (Bacterial Proteins) ; 0 (Enzymes) ; 0 (Escherichia coli Proteins) ; 0 (Pentosephosphates) ; 0 (Terpenes) ; 0 (hydroxymethylbutenyl 4-diphosphate synthase) ; EC 1.- (Oxidoreductases) ; EC 1.- (ispH protein, E coli) Entry Date(s): Date Created: 20011122 Date Completed: 20011226 Latest Revision: 20181113 Update Code: 20240513 PubMed Central ID: PMC95591

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The lytB gene of Escherichia coli is essential and specifies a product needed for isoprenoid biosynthesis.